已測序基因組的雜合度,重複序列水平怎麼查詢

時間 2023-01-16 06:35:01

1樓:此處時光最美

基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,**罹患多種疾病的可能性,個體的行為特徵及行為合理,如癌症或白血病,運動天賦,酒量等。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術。

基因組大小(size of genome)是指單倍體細胞核中的所含的dna的總量。在可以進行基因組測序之前,生物學家是用質量來衡量不同生物之間基因組的大小。通常使用的單位為pg(10e-12),這個值簡稱為c-value.

通過簡單的換算就可以知道大概的鹼基的數量。不過,對於已經測序的基因組,直接數數就可以了,如 vihole所述。不過對於目前測序的基因組還是很少,估計在1千左右,而現存物種按照最保守的估計也有200萬種(ref 1),因此c-value在估計基因含量和生物複雜度方面還是有非常大的應用潛力。

雜合度是怎麼樣影響基因組組裝的

2樓:小菲徽芯

已測序基組雜合度重複序列水平查詢。

基組(size of genome)指單倍體細胞核所含dna總量。進行基組測序前,物家用質量衡量同物間基組。通使用單位pg(10e-12),值簡稱c-value.

通簡單換算知道概鹼基數量。,於已經測序基組,直接數數, vihole所述。於目前測序基組少,估計1千左右,現存物種按照保守估計200萬種(ref 1),c-value估計基含量物複雜度面非應用潛力。

選取一個已經完成的基因組測序的物種的基因查詢

重測序比較兩個樣品之間的差異,為什麼要跟參考基因

怎樣檢查基因組註釋結果的可靠性

基因組測序原始資料需要刪除重複序列麼

3樓:臺鴻飛

不需要重複序列只是 表面上的重複,生物學作用,未知。

未知情況下,不要刪除。

關於基因測序的幾個問題!

4樓:匿名使用者

根據一些文獻的支援,先片段化,效果較好。因為這樣的隨機性比先合成要好。

2.加入index只是為了區分每個上機樣品,便於分析。對結果沒有什麼目的和影響。

3.如果技術試驗流程沒有問題的話,有的時候是因為物種本身的特殊性,諸如,雜合度過高,重複序列過高。

已經有轉錄組測序結果,怎麼看是否含有某個基因?

5樓:美吉生物

是有參考基因copy組的還是de novo的結果bai,如果有參考基du

因組的,那麼可以通過這個zhi基因名dao

稱在註釋結果中查詢是否有這個基因,序列資訊需要在參考基因組中查詢,如果是沒有參考基因組的,那麼拼接結果是一個fasta格式的檔案,可以用blast軟體進行比對。

6樓:西門寒雪

有專門的軟體,你找你們老師一問就知道了,非常簡單的。

7樓:匿名使用者

貌似 木有什麼工作量吧 就是一個比對而已。

8樓:匿名使用者

用基因探針,可配對既含有某基因。

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