crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(1)確定目標基因
1樓:新科技
前陣子才寫道
crispr-cas9基因敲除實驗步驟 month 4 --可能的收官之帖(但還遠未結束)
說自己收官之作,**想到這麼快就要繼續開始新的實驗了。
有幾點要宣告:首先,這些記錄都是我真是的實驗思路歷程,出於保密原則,不會透露課題任何敏感資訊,所有例子均為杜撰;其次,我知無不言但不一定能言盡,畢竟篇幅有限;再者,這些只是我個人的記錄,疑問僅是出於好意;之前有人問我要protocol,其實我想說,思路是最重要的,實驗protocol**去拿不到呢;最後,我感謝一直以來幫助我的人們,正是因為接受了這麼多的幫助,才促使我寫下這些紀錄希望能幫助到別人,感謝。
**上傳失敗。image-2bfdf5-1563514224716)]
首先知道自己要做什麼,明確目標之後要儘可能利用自己能用到的所有資源,快速,精準的篩選目的基因。
感謝師兄dz
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(6)正式轉染+單轉殖細胞篩選
2樓:戶如樂
先確定目標基因
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(1)
然後對目的基因進行背景調查
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(2)磨刀不誤砍柴工。
設計sgrna及引物
crispr-cas9(三)--sgrna設計好之後。
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(3)sgrna及引物設計。
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(4)構建sgrna+cas9載體。
轉染驗證
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(5)293ft細胞轉染驗證 and trouble shooting
事實上,在轉染驗證結束後,對於癌細胞等易轉染細胞系,基本上可以立刻進行轉染,如果載體帶有螢光,則根據螢光篩選陽性細胞,若載體為抗生素抗性,而經過抗生素篩選後可直接進行下一步單轉殖細胞篩選。對於難以轉染的細胞系,可使用電轉或者特殊的轉染試劑,再根據螢光或者抗性篩選。
將細胞消化過篩後種96孔板,每孔種乙個細胞,前提是要有活細胞工作站,可以定時拍照1星期以上,從而確定單細胞轉殖,如果沒有這樣的儀器,網路上還有其他篩選單細胞的教程,比如稀釋法等等(我覺得直接種1孔1個細胞就ok,種完就找到得力的顯微鏡全孔拍攝)。總而言之,篩選單細胞這一步依賴於實驗室平臺的條件。
我已經在前兩週完成了轉染+螢光篩選+擴增凍存一部分,目前種板準備篩選單細胞轉殖。由於我養的細胞屬於非常難轉的細胞系,使用了特殊的轉染試劑,轉染過後細胞不耐受,螢光篩選之後更加脆弱,實驗週期相應拉長。注意,最遲最遲在確認轉染成功後開始訂購所需的驗證性抗體。
實驗並非乙個人可以完成,這和實驗室的管理,補給,運營還有實驗室成員的幫助有很大的關係,每乙個微小的步驟都有可能把人卡得生不如死,希望能順順利利,感恩。
crispr-cas9基因敲除實驗步驟 day
3樓:戶如樂
這裡我們先前已經完成: crispr-cas9基因敲除sgrna設計。
1.輸入目標基因組dna序列。
我們提供**crispr設計工具可以輸入序列(例如,來自目的區域的乙個1kb基因片段),識別和排列合適的靶位點,計算**每個指定靶標的off-target位點。或者,可以通過確認任何5』-ngg直接上游的20-bp序列手動選擇引導序列。
設計ssodn模板(任選) 1 h我們沒有選這個方法--略。
3.設計和訂購定做的ssodn。
4.重新溶解和稀釋ssodn ultramers到終濃度10um。
5.為了構建sgrna表達結構,使用pcr表達cassette(選項a)或以質粒為基礎的步驟(選項b)--我們選擇了方案b
a)通過pcr擴增構建sgrna表達結構 2 h--沒選這個方案,略。
(b)sgrna cloning進入pspcas9(bb)質粒,與cas9共表達 3 d
pause point:此處理後,反應可以儲存在-20℃至少1周
感謝師兄dz
crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(3)sgrna及引物設計
4樓:天羅網
先確定目標基因crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(1)然後對目的基因進埋前行背景調查crispr/cas9基因敲除實驗全記錄(2)磨刀不氏困誤砍柴工設計sgrna及引物crispr-cas9(三)--sgrna設計好之後對殲液念前期文章的補充設計sgrna之後,需要對結果進行判斷:
提交訂單,等待引物到達:華大基因的速度非常快,大約在2-3個工作日即可拿到,在等待期間需要準備好:
感謝師兄dz
基於ARM9的溫度採集裝置設計,基於arm9的數字溫度監測系統設計好做嗎
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